آب چغاخور از سرچشمه هایی چون سیبک، زوردگان، تنگ سیاه و ... تامین می شود.خصوصیات منحصر به فرد تالاب، موجب رشد گونه‌های مختلف گیاهی و جانوری چون ماهی و پرندگان کمیاب و زیبا در این محل شده است. این تالاب يكي از 105 تالاب مهم كشور براي پرندگان آبزي و يکی از مناطق مهم پرنده نگری در ايران محسوب مي‌شود. از پرندگان تالاب بین المللی چغاخور میتوان به گونه هایی چون آنقوت، فلامینگو، غاز، اردک، لک لک سفید، مرغابی، سلیم اشاره کرد. علاوه براین گونه هایی نظیر چنگر، حواصیل، قو، کشیم، باکلان، خروس کولی ، کاکایی، و ... نیز در این تالاب وجود دارند. وجود این پرندگان باعث جذب علاقه مندان به پرنده نگری به این منطقه شده است. جانورانی چون روباه، گراز، شغال، خرگوش ،گرگ، سمور سنگی، لاک پشت آبزی، بزمجه، و ... پوشش جانوری این تالاب را تشکیل میدهند. در میان ماهی هایی که در این تالاب زندگی میکنند می توان از ماهی گورخری، گامبوزیا، فيتوفاگ، بيگ هد ، ماهي قرمز و ... نام برد. تالاب چغاخور از نظر جغرافیای گیاهی ایران در بخش کوهستانی منطقه رویشی ایران و تورانی واقع شده است، اما پوشش گیاهی تالاب چغاخور و محیط اطراف آن تحت تاثیر سیستم هیدرولوژیک تالاب قرار گرفته و دارای گیاهان آبزی و تالابی است. به طور کلی تالاب چغاخور یکی از زیباترین تالاب های ایران است و با وجود گونه های بی شمار گیاهی، پرنده های نادر و زیبا و مناظر ارتفاعات اطراف یکی از چشم نوازترین جاذبه های استان چهارمحال و بختیاری را تشکیل می دهد.